Arabidopsis Μοτίβο σαρωτή (AMS) είναι μια εφαρμογή των Windows που τρέχει σε τοπικούς υπολογιστές. Αναπτύχθηκε για την κατασκευή δικτύων γονιδίων με τον προσδιορισμό των θέσεων των cis-ρυθμιστικών στοιχείων στο Arabidopsis thaliana μοντέλο των φυτών και παρέχοντας μια εύκολη διασύνδεση για την εκτίμηση και αξιολόγηση των γονιδίων σχέσεις. σημαντικό καινοτόμο χαρακτηριστικό του είναι να συνδυάσει τις θέσεις στοιχείο cis-ρυθμιστικών, NGS και DNA Chip Arrays δεδομένα έκφρασης, επισημειώσεις Arabidopsis και αλληλεπιδράσεις γονίδιο για την ταυτοποίηση των δικτύων γονιδίου ρυθμίζεται από παράγοντες μεταγραφής. Σε μελέτες επικεντρώνονται σε παράγοντες μεταγραφής λειτουργία, το λογισμικό χρησιμοποιεί τα δεδομένα έκφρασης και δεσμευτική μοτίβα ιστοσελίδα στις ρυθμιστικές περιοχές του γονιδίου για να προβλέψει την άμεση γονιδίων στόχων. Επιπλέον, AMS χρησιμοποιεί δεδομένων DNA-πρωτεΐνης και αλληλεπίδραση proteinprotein να διευκολυνθεί η αναγνώριση των μεταβολικών οδών που ρυθμίζονται από τον παράγοντα μεταγραφής του ενδιαφέροντος.
Τα σχόλια δεν βρέθηκε