Bibliosphere Analysis Kit

BiblioSphere προσφέρει ένα μοναδικό συνδυασμό της λογοτεχνίας, της εξόρυξης και ανάλυσης μονοπάτι για μοριακούς βιολόγους ενδιαφέρονται για την ρύθμιση των γονιδίων και βιολογικών δικτύων.
 BiblioSphere Pathway Edition χρησιμοποιεί μια ολοκληρωμένη βάση δεδομένων ατομικά πρότυπο σχέσεων μεταξύ των γονιδίων, πρωτεϊνών, συγκροτήματα, τα κύτταρα και τους ιστούς μαζί με up-to-ημερομηνία τεχνικές εξόρυξης κειμένου για την αυτοματοποιημένη εξαγωγή γνώσης που σας επιτρέπει να συνδέσετε τα δεδομένα σας σε βιολογικούς δίκτυα σε διάφορες βιολογικές εφαρμογές.
 Χρησιμοποιήστε BiblioSphere να

• επεκτείνει βιολογικών δικτύων πέραν των κανονικών πληροφορίες οδού (κανονιστική & μεταβολικές)
• συγχώνευση αποτελέσματα υψηλής απόδοσης σας με βιολογική γνώση και ανάλυση της αλληλουχίας με βάση
• εκτελέσει συμφραζόμενα ευαίσθητη ρυθμιστική ανάλυση μονοπάτι
• Δημιουργία πείραμα-ειδικές παραλλαγές μονοπάτι
• σύνδεση οδοί προς τους μηχανισμούς της ασθένειας και τα γονίδια
• προχωρημένες πειραματικό σχεδιασμό

Τι είναι καινούργιο σε αυτήν την έκδοση:

Η νέα και βελτιωμένη Πηγές Δεδομένων

• Genomatix εμπειρογνωμόνων Curated των γονιδίων Σχέσεις:
   Genomatix έχει ενσωματωθεί ιδιόκτητο βάση γνώσεων του επιμέλεια δεδομένων ειδικός στη γονιδιακή ρύθμιση στο BiblioSphere. Αυτή η μοναδική πηγή δεδομένων προσθέτει τη σημασιολογία των των γονιδίων σχέσεις με τα δυναμικά παραγόμενο γονίδιο δίκτυα BiblioSphere, παρέχοντας πληροφορίες, όπως «Ένα γονίδιο ενεργοποιεί τη μεταγραφή του γονιδίου Β" ή "Ένα γονίδιο αλληλεπιδρά φυσικά με το γονίδιο Β".
  
• μονοπάτια μεταγωγής σήματος:
   Έχουν τμήματα του Gene Οντολογίας σχετικές με μεταγωγή σήματος, καθώς και δεδομένα που συγκεντρώνονται από τη βιβλιογραφία έχουν συνδυαστεί για να επιτρέψουν την ταυτοποίηση των κανονικών οδών που συνδέονται με την εστιασμένη δίκτυο.
  
• μεταβολικό μονοπάτι Σύλλογοι:
   Έχουν μεταβολικό μονοπάτι ενώσεις έχουν ενσωματωθεί να επιτρέψουν την αναγνώριση των μεταβολικά γεγονότα που σχετίζονται με τη συσκευή σας από τα γονίδια.
  

• Διαδρομή Δείτε με εμπειρογνώμονα επιμέλεια των γονιδίων σχέσεις
   Οι ομάδες γονιδίων συγκεντρώνονται σε εύκολα κατανοητή δυναμικά γραφήματα δίκτυο που συνδυάζει το χέρι επιμέλεια σχέσεις των γονιδίων με τα δεδομένα που προέρχονται από αυτοματοποιημένη εξαγωγή γνώσης. Τα δίκτυα μπορούν να προσαρμοστούν από τα φίλτρα και επικεντρώθηκε σε ένα γονίδιο που επικεντρώνεται τρόπος για να εκτελέσει συντομότερη διαδρομή ανάλυση.
  
• κυτταρικού εντοπισμού Προβολή
   Βασισμένο στο GO σχολιασμοί γονίδια έχουν ανατεθεί σε ενδοκυτταρική τους θέση και να παρουσιασθεί σε διαγραμμίζεται διάταξη των κυττάρων, η οποία σας επιτρέπει να εντοπίσει υποκυττάρια περιοχές και τα διαμερίσματα που σχετίζονται με σύνολο γονιδίου σας.
  

• Διαχείριση Έργου: Διαχειριστείτε τις αναλύσεις σας, οργανώνοντας τα σε φακέλους του έργου. Γρήγορη πρόσβαση προηγούμενα αποτελέσματα με μερικά κλικ του ποντικιού ή να προσθέσετε νέες αναζητήσεις υφιστάμενων έργων.
  

• Διάφορα μικρές βελτιώσεις και διορθώσεις σφαλμάτων

Απαιτήσεις :

• Mac OS X 10.2 ή νεότερη έκδοση
• Java 1.4.1 (update 1 συνιστάται)
• σύνδεση στο internet
• ένα λογαριασμό αξιολόγηση Genomatix (χωρίς χρέωση)