BioPerl

BioPerl αναπτύχθηκε για την επεξεργασία βιολογικών δεδομένων σε Perl.
Είναι ένα εργαλείο για τη διερεύνηση των δυνατοτήτων της Perl στον κόσμο βιοπληροφορικής

Τι είναι καινούργιο σε αυτή την έκδοση:.

• Κύριες ενημερώσεων των Windows στήριξης
• ενημέρωση Maker για να καταστεί δυνατή η αυστηρότερη πρότυπο πίνακα κωδικονίων
• Καλύτερη υποστήριξη για κυκλικές ακολουθίες
• Διορθώσεις για ορισμένους τύπους συγκρότημα τοποθεσία
• Διεύθυνση Contig σφάλμα σε μορφή GenBank
• διορθώσεις Deobfuscator

Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 1.6.922:.

• αποτυχίες δοκιμή CPAN Διεύθυνση
• Προστέθηκε υποστήριξη για αρχεία Bioproject Genbank.
• Καλύτερη regex υποστήριξη για έξοδο HMMER3.

Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 1.6.901:

• Χρήση του AcePerl έχει καταργηθεί? Ace.pm δεν διατηρείται ενεργά, και μονάδες που χρησιμοποιούν Ace θα πρέπει επίσης να καταργηθεί.
• Μικρά απελευθέρωση bug fix.
• Βιογραφικό :: δοκιμές SeqIO :: gbxml απαιτούν XML :: SAX.
• θέματα Διεύθυνση Build.PL όταν DBI δεν υπάρχει.
• Μετάβαση gbxml.t και Interpro δοκιμασίες, όταν δεν έχει εγκατασταθεί μονάδες.
• Κατάργηση αποδοκιμασμένο κώδικα για Perl 5.14.0 compat.
• Λόγω των αλλαγών σχήματος και έλλειψη υποστήριξης για τις παλαιότερες εκδόσεις, υποστήριξη για NeXML 0.9 είναι μόνο (πολύ) εν μέρει.