CLC DNA Workbench

CLC DNA Workbench δημιουργεί ένα περιβάλλον λογισμικού που επιτρέπει στους χρήστες να κάνουν ένα μεγάλο αριθμό προηγμένων σειράς αναλύσεων DNA, σε συνδυασμό με την ομαλή διαχείριση των δεδομένων, και την άριστη γραφική προβολή και εξόδου επιλογές.
CLC DNA Workbench είναι διαθέσιμο για Windows, Mac OS X και Linux πλατφόρμες

Χαρακτηριστικά :.

• Βιοπληροφορική διαθέτει στο Gene Workbench :
• Ευέλικτη προβολή των κυκλικών μορίων.
• Επεξεργαστής για γραφικά και αλγοριθμικά προχωρήσει αστάρι σχεδιασμό
• Συνέλευσης των δεδομένων αλληλουχίας DNA
• Μοριακή κλωνοποίηση
• Αυτόματη SNP σχολιασμό των ακολουθιών
• Αναζήτηση και ανακάλυψη των προτύπων DNA
• αναλύει Τοπική περιοχή πολυπλοκότητα
• αντίστροφη μετάφραση από πρωτεΐνη σε γονίδιο, με βάση τους πίνακες μετάφρασης από έναν αριθμό ειδών
• Για προχωρημένους ανάλυσης και διαχείρισης ένζυμο περιορισμού
• Dot αναλύσεις βασίζονται οικόπεδο
• στατιστικές DNA Σύντομη μορφή, συμπεριλαμβανομένου ενός αριθμού χαρακτηριστικών ενός συγκεκριμένου μορίου
• NCBI αναζήτηση δεδομένων ακολουθία
• Η πρόσβαση σε πληροφορίες στο διαδίκτυο από το PubMed
• Άλλα χαρακτηριστικά της βιοπληροφορικής:
• DNA, RNA και συντάκτης πρωτεϊνική ακολουθία εμφανίζει γραμμική και κυκλική μόρια
• DNA, RNA, και συντάκτης ευθυγράμμιση πρωτεΐνης
• Interactive λογότυπα κατά μήκος των δύο DNA, RNA και πρωτεϊνών ευθυγραμμίσεις
• Μαζική επεξεργασία των αναλύσεων σε πολλαπλές σειρές σε ένα έργο-βήμα
• Αναζήτηση Μοτίβο
• ανακάλυψη Pattern (άγνωστο μοτίβα)
• Για προχωρημένους εκ νέου ευθυγράμμιση και να καθορίσει σημείο στοίχιση
• Ακολουθία logo γραφήματα μήκος του DNA, RNA και πρωτεϊνών ευθυγραμμίσεις
• χειρωνακτικό σχολιασμό των ακολουθιών
• Ολοκληρωμένα PubMed αναζητήσεις
• Web-based αναζήτηση ακολουθία χρησιμοποιώντας BLAST
• Dot αναλύσεις βασίζονται οικόπεδο
• Τοπική περιοχή της πολυπλοκότητας αναλύει και οικόπεδα πολυπλοκότητα
• γραφήματα κλάσμα Gap
• G / C ανάλυση περιεχομένου και γραφήματα
• Έργου και διαχείρισης δεδομένων:
• Πλήρης ενσωμάτωση της εισόδου δεδομένων, διαχείριση δεδομένων, τα αποτελέσματα των υπολογισμών, και εξαγωγή δεδομένων
• λεπτομερές αρχείο καταγραφής της ιστορίας
• Όλοι οι τύποι αρχείων μπορούν να αποθηκευτούν σε τοπικά έργα, και ξεκίνησε από το πρόγραμμα
• Εισαγωγή και εξαγωγή δεδομένων σε ένα μεγάλο αριθμό φορμά αρχείων
• Δυνατότητα εργασίας σε διάφορους χώρους εργασίας που δραστηριοποιούνται σε έναν χρόνο, επιτρέποντας την ταυτόχρονη εργασία σε πολλαπλά έργα
• Εισαγωγή αρχείων δεδομένων ίχνος και βαθμολογίες από μηχανήματα αυτόματης sequening DNA χρησιμοποιώντας πρότυπο Chromatogram μορφή, ABI μορφές και τη μορφή PHD (PHRED)
• Προβολή και υποβολή εκθέσεων:
• Αναλυτική προβολή BLAST
• Για προχωρημένους γραφήματα δείτε
• Αναλυτική προβολή ιστόγραμμα
• Αναλυτική προβολή διάγραμμα σημείων
• Αναζήτηση χαρακτηριστικά σε ακολουθίες και ευθυγραμμίσεις

Απαιτήσεις :

• 256 MB μνήμη RAM που απαιτείται
• 512 MB RAM προτεινόμενη
• 1024 x 768 οθόνη συνιστάται

Περιορισμοί :

• 4-εβδομάδων πλήρως λειτουργική demo