KEGG2SBML

Η Βιολογία Συστημάτων Markup Language (SBML) είναι ένα XML με βάση τη γλώσσα περιγραφής για την εκπροσώπηση υπολογιστικών μοντέλων σε συστήματα βιολογίας και της βιοπληροφορικής.
KEGG2SBML δυνατότητες είναι επί του παρόντος περιορίζεται στη μετατροπή των αρχείων μόνο KEGG μεταβολικό μονοπάτι και όχι σε άλλους τύπους αρχείων KEGG.
KEGG2SBML μπορεί να μετατρέψει KEGG Διαδρομή βάσης δεδομένων Release 46.0 ή νεότερη έκδοση. (Εκλύσεις κατά το παρελθόν από KEGG Διαδρομή βάσης δεδομένων δεν έχουν ελεγχθεί και δεν μπορούν να μετατραπούν από KEGG2SBML.)
Μπορεί να δημιουργήσει SBML επιπέδου 1 και 2 (Έκδοση 1), με ή χωρίς σχολιασμούς που χρησιμοποιούνται από CellDesigner και SBML Επίπεδο 2 Έκδοση 2 και Επίπεδο 2 Έκδοση 3 χωρίς σχολιασμούς.

Τι είναι καινούργιο σε αυτή την έκδοση:.

• Οι αλλαγές στην parsing KEGG Διαδρομή
• Αλλαγές στο parsing KEGG συνδετήρα.
• Αλλαγές γραπτώς SBML.
• KGML δεν χρησιμοποιείται πλέον από αυτή την έκδοση.