PANAMA

Ο Παναμάς είναι μια νέα πιθανολογική μοντέλο για να εξηγηθούν παράγοντες που επηρρεάζουν eQTL μελέτες, γραμμένο σε Python.
Κρυφό συγχυτικούς παράγοντες, όπως απαρατήρητες συμεταβλητές ή άγνωστο λεπτές περιβαλλοντικές διαταραχές μπορούν να δημιουργήσουν ψευδή ψευδείς ενώσεις ή απόκρυψη της πραγματικής σήματα γενετική συσχέτιση. Σε αντίθεση με τις προηγούμενες μεθόδους, ΠΑΝΑΜΑ μαθαίνει κρυφό παράγοντες από κοινού με την επίδραση των γενετικών εξέχοντα ρυθμιστικών αρχών. Ως αποτέλεσμα, το νέο αυτό μοντέλο μπορεί να διακρίνει με μεγαλύτερη ακρίβεια αλήθεια σήματα γενετική συσχέτιση από σύγχυσης παραλλαγή.
Ν Fusi, Ο. Stegle και ΝΔ Lawrence, "Κοινή μοντελοποίηση των παραγόντων σύγχυσης και επιφανείς γενετικών ρυθμιστών παρέχει αυξημένη ακρίβεια σε γενετικούς γονιδιωματικής μελέτες», PLoS Υπολογιστικής Βιολογίας, 2012
Περισσότερες πληροφορίες στο http://ml.sheffield.ac.uk/qtl/panama.html

Requirements:

• Python