CWC Simulator

ΣΧΟ Simulator είναι ένα C ++ εφαρμογή της CWC, ενός λογισμού για την εκπροσώπηση και την προσομοίωση των βιολογικών συστημάτων & nbsp?. Μετά από μια επιτυχημένη εγκατάσταση (δείτε Εγκατάσταση) θα είστε σε θέση να εκτελέσετε τις προσομοιώσεις πάνω ΣΧΟ μοντέλα, όπως φαίνεται σε ορισμένα παραδείγματα (βλέπε παραδείγματα /).
(γραμμής εντολών) Διασύνδεση
Ως χρήστης γενικής χρήσης, θα πρέπει να εκτελέσετε:

-i model.cwc
-o <στατιστικά στοιχεία>
-t
-s
-n <τρέχει>
-c <συστάδες>
--qt-όριο <όριο>
-q <ποσοστημορίων>
-w <εργαζομένων>
Πού:
- είναι το όνομα του εκτελέσιμου (προεπιλογή: scwc)?
& Nbsp? - Model.cwc είναι η CWC πρόγραμμα εισόδου (δείτε παραδείγματα)?
& Nbsp? - Στατιστικές είναι το πρόθεμα εξόδου αρχεία?
& Nbsp? - είναι το όριο προσομοίωση χρόνο?
& Nbsp? - είναι η περίοδος δειγματοληψίας (δηλαδή 0,12 για να πάρετε 250 πόντους με προθεσμία = 30)?
& Nbsp? - <Τρέχει> είναι ο αριθμός των περιπτώσεων προσομοίωσης?
& Nbsp? - <Συστάδες> είναι ο αριθμός των συστάδων για τον k-means
& Nbsp? - είναι το όριο για την επιμήκυνση του συμπλέγματος
& Nbsp? - <Ποσοστημορίων> είναι ο αριθμός των ποσοστιαίων?
& Nbsp? - <Εργαζομένων> έχει συνήθως να ταιριάζει με τον αριθμό των πυρήνων του συστήματος σας (δηλαδή 4 για quad-core CPU).
Έξοδος
Το εργαλείο παράγει:
- Ορισμένα αρχεία .dat (το δείγμα εξόδου των προσομοιώσεων)
- Ορισμένα σενάρια gnuplot για την εξαγωγή στατιστικών ανάλυση η
Δουλεύουμε σε ένα ολοκληρωμένο εγχειρίδιο

Χαρακτηριστικά :.

• Gillespie SSA αλγόριθμο πάνω ΣΧΟ μοντέλα
• Υβριδική στοχαστική / ντετερμινιστική σημασιολογία
• Πολλαπλές εμφανίσεις της προσομοίωσης με online στατιστικών
• Βελτιστοποίηση για τις αρχιτεκτονικές πολλαπλών πυρήνων βασίζεται στο πλαίσιο FastFlow
• Extensible στατιστικού πλαισίου (μέση-διακύμανσης, φιλτράρεται ομαδοποίηση κλπ.)
• Πολλαπλές σημασιολογία βαθμολογία (μαζική δράση, Michaelis-Menten, Λόφος κλπ.)