Προβολή της πρωτεΐνης-πρωτεΐνης και συνδετήρα-πρωτεϊνικές αλληλεπιδράσεις και γραφήματα (δίκτυα), όπου τα βιομόρια εκπροσωπήθηκαν ως κόμβοι και οι αλληλεπιδράσεις τους εκπροσωπήθηκαν ως σύνδεσμοι, είναι μια πολλά υποσχόμενη προσέγγιση για την ενσωμάτωση πειραματικά αποτελέσματα από διάφορες πηγές για να επιτευχθεί η συστηματική κατανόηση των μοριακών μηχανισμών οδήγηση κυττάρων φαινότυπο. Η εμφάνιση των δικτύων σηματοδότησης μεγάλης κλίμακας παρέχει μια ευκαιρία για τοπολογικές στατιστική ανάλυση, ενώ οπτικοποίηση των εν λόγω δικτύων αποτελεί μια πρόκληση. SAVI εφαρμόζει πρότυπες μεθόδους για να υπολογίσει την ομαδοποίηση, διανομή συνδεσιμότητα και ανίχνευσης, καθώς και την απεικόνιση, μοτίβων του δικτύου. Επιπλέον, SAVI παράγει μια πλήρη ιστοσελίδα από σύνολα δεδομένων του δικτύου σε μορφή κειμένου. SAVI περιέχει ένα εργαλείο που ονομάζεται PathwayGenerator. Αυτό το εργαλείο δημιουργεί χάρτες σύνδεση, όπως ιστοσελίδες από μεγάλους πίνακες που περιγράφουν τις αλληλεπιδράσεις κυτταρική σηματοδότηση. SAVI μπορεί επίσης να δημιουργήσει δίκτυα από τους καταλόγους με τα ονόματα γονιδίων / πρωτεϊνών
Έκδοση 2.5 μπορεί να περιλαμβάνει ενημερώσεις απροσδιόριστη, βελτιώσεις ή διορθώσεις σφαλμάτων
Απαιτήσεις :..
των Windows (όλες)
Τα σχόλια δεν βρέθηκε