Screenshot Λογισμικό:
Στοιχεία Λογισμικού:
Εκδοχή: 1.5.13 επικαιροποιημένο
Ανεβάστε ημερομηνία: 26 Apr 16
Προγραμματιστής: The CDK Project
Άδεια: Δωρεάν
Δημοτικότητα: 196
Η Development Kit Χημείας (επίσης γνωστή ως CDK) είναι μια πλατφόρμα-ανεξάρτητη, διανέμεται δωρεάν και ανοικτού κώδικα λογισμικό βιβλιοθήκη υλοποιηθεί σε Java και σχεδιασμένο ειδικά για τις διαρθρωτικές βιοπληροφορική, cheminformatics και υπολογιστική χημεία.
Το έργο αποτελείται από διάφορα χρήσιμα αλγορίθμων και δομών δεδομένων, προσαρμοσμένες ειδικά για τους προγραμματιστές που θέλουν να σώσουν πολύ χρόνο και προσπάθεια από την επαναχρησιμοποίηση κώδικα. Η Χημεία Development Kit δεν έχει σχεδιαστεί για να χρησιμοποιείται από τους τελικούς χρήστες.
Χαρακτηριστικά με μια ματιά
Βασικά χαρακτηριστικά περιλαμβάνουν υποστήριξη για την ανάγνωση και τη γραφή μορφές χημικών δεδομένων, υποστήριξη για την απόδοση χημικές δομές, υποστήριξη για QSAR (Quantitative Structure & ndash? Δραστηριότητα Σχέσεις). Περιγραφείς, καθώς και ενσωματωμένο αλγορίθμους για την υποστήριξη της θεωρίας χημική γράφημα
Για την καλύτερη εξυπηρέτησή σας, η εφαρμογή διανέμεται ως προ-μεταγλωττισμένα εκτελέσιμα πακέτα σε μορφή αρχείου JAR. Για να το χρησιμοποιήσετε στο έργο σας, απλά κατεβάστε την τελευταία σταθερή έκδοση από Softoware χρησιμοποιώντας τον παραπάνω σύνδεσμο, όπου μπορείτε επίσης να βρείτε το πρόγραμμα & rsquo?. S tarball πηγή
Οι προγραμματιστές θα βρείτε αναλυτικές πληροφορίες σχετικά με το πώς να καταρτίσει το πρόγραμμα από πηγές, πώς να τρέξει διάφορες δοκιμές, καθώς και πώς να το χρησιμοποιήσετε και σε άλλα προγράμματα στο αρχείο Readme.txt που βρίσκεται μέσα στο αρχείο tar.gz.
Κάτω από το καπό και υποστηρίζεται λειτουργικά συστήματα
Ρίχνοντας μια ματιά κάτω από την κουκούλα της CDK (Chemistry Development Kit), το λογισμικό, μπορούμε να αναφέρουμε ότι έχει γραφτεί εξ ολοκλήρου στη γλώσσα προγραμματισμού Java.
Προς το παρόν, είναι πλήρως συμβατό με 32-bit και 64-bit γεύσεις του GNU / Linux, Microsoft Windows και τα λειτουργικά συστήματα Mac OS X. Ωστόσο, θα πρέπει να λειτουργεί σε οποιοδήποτε λειτουργικό σύστημα που υποστηρίζεται από το Java Runtime Environment (JRE) & nbsp? Και Κιτ Ανάπτυξης Java (JDK) & nbsp? Τεχνολογίες
Τι είναι καινούργιο σε αυτή την έκδοση:
- Η επίσημη κατηγορία της IAtomcontainer μεταφέρεται σε IMolecularFormula
- Διορθώθηκε το bug 2787332 Η παλιά σειρά ομολόγων κατά τον υπολογισμό τέλους Gasteiger ορίστηκε στο
- Ενημέρωση για να διορθώσετε το σφάλμα 2788357 SMARTSQueryTool πιάνει τώρα TokenMgrError στο κατασκευαστικής
- Προστέθηκε νέα taglet να επεξεργαστεί cdk.githash ετικέτας και σύνδεση Javadocs με πηγές στο Git repo
- Ενημέρωση ετικέτες cdk.svnrev να cdk.githash ετικέτες
- Bug_2787332. Προστέθηκε τεστ για το μόριο Triclosan (InChI = 1 S / C12H7Cl3O2 / c13-7-1-3-11
- Αφαιρέθηκε παρωχημένες κωδικό renderer: είτε η χρήση CDK-1.0.x ή jchempaint-πρωτοβάθμια
- Προστέθηκε τεστ για bug 2786624 στη σουίτα δοκιμής αναλυτή
- Προστέθηκε συνδέσμους σε σελίδες PMD
- Προστέθηκε σύνδεση με τα στατιστικά JUnit
- λίστα των κατηγοριών Προστέθηκε στη μονάδα, με συνδέσεις προς διανυκτέρευσης @ Πελέ
- Προστέθηκε που έχει συσταθεί για τη δημιουργία σελίδων ενότητα HTML
- Προστέθηκε που έχει συσταθεί για τη δημιουργία σελίδων ενότητα HTML
Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 1.5.10:
- Η επίσημη κατηγορία της IAtomcontainer μεταφέρεται σε IMolecularFormula
- Διορθώθηκε το bug 2787332 Η παλιά σειρά ομολόγων κατά τον υπολογισμό τέλους Gasteiger ορίστηκε στο
- Ενημέρωση για να διορθώσετε το σφάλμα 2788357 SMARTSQueryTool πιάνει τώρα TokenMgrError στο κατασκευαστικής
- Προστέθηκε νέα taglet να επεξεργαστεί cdk.githash ετικέτας και σύνδεση Javadocs με πηγές στο Git repo
- Ενημέρωση ετικέτες cdk.svnrev να cdk.githash ετικέτες
- Bug_2787332. Προστέθηκε τεστ για το μόριο Triclosan (InChI = 1 S / C12H7Cl3O2 / c13-7-1-3-11
- Αφαιρέθηκε παρωχημένες κωδικό renderer: είτε η χρήση CDK-1.0.x ή jchempaint-πρωτοβάθμια
- Προστέθηκε τεστ για bug 2786624 στη σουίτα δοκιμής αναλυτή
- Προστέθηκε συνδέσμους σε σελίδες PMD
- Προστέθηκε σύνδεση με τα στατιστικά JUnit
- λίστα των κατηγοριών Προστέθηκε στη μονάδα, με συνδέσεις προς διανυκτέρευσης @ Πελέ
- Προστέθηκε που έχει συσταθεί για τη δημιουργία σελίδων ενότητα HTML
- Προστέθηκε που έχει συσταθεί για τη δημιουργία σελίδων ενότητα HTML
Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 1.2.2:
- Σταθερή συνδέσεις. Αναντίστοιχο, καθώς ο δρόμος εξακολουθεί να είναι ενσωματωμένες σε ένα ενιαίο διανυκτέρευσης παράδειγμα, αλλά δεν έχουμε το πλαίσιο XML ακόμα να συνοψίσει τα πράγματα πάνω από όλα nightlies (τρέξιμο
- Ενημέρωση αριθμό έκδοσης
- Προστέθηκε δοκιμή για να εξασφαλίσει IAtomContainers δεν κρυφά στο μέσω IMoleculeSet.add (IAtomContainerSet)
- αντικατασταθούν addAtomContainer (IAtomContainer, διπλά) πάρα πολύ, για να ρίξει μια IllegalArgumentException όταν έχει περάσει ένας μη-IMolecule
- Τώρα ρίχνει μια IllegalArgumentException όταν προσπάθησε να αποθηκεύσετε ένα IAtomContainer που δεν είναι IMolecule
- Προστέθηκε δοκίμιο για # 2784182
- νέα δοκιμή με ρεσερπίνη
- Προστέθηκε taglets για το πέρασμα της ασφάλειας
- Με το ένα άτομο ή λιγότερο, ορίζουμε να μπορεί να συνδεθεί, καθώς δεν υπάρχει απαιτούνται για στεγανοποίηση (διορθώσεις # 2784209, NullPointerException για IAtomContainer χωρίς άτομα)
- Προστέθηκε μονάδα δοκιμών για bug # 2784209 το οποίο αποτυγχάνει σήμερα
- Περισσότερα αφαίρεση της ρητής org.openscience.cdk ονόματα πακέτου: ρίχνει ρήτρες
- Περισσότερα αφαίρεση των ονομάτων πακέτου ρητή org.openscience.cdk
- Περισσότερα απομάκρυνση των ρητών ονόματα πακέτου org.openscience.cdk: για τις νέες org.openscience.cdk.Foo () καλεί
- Αφαιρέθηκε ρητή org.openscience.cdk.interfaces πακέτα ονόματα (διορθώσεις # 2783549)
- Αφαιρέθηκε ρητή ονόματα πακέτων, υπέρ των εισαγωγών, για org.openscience.cdk στη μονάδα datadebug (διορθώσεις # 2783549)
- Αφαιρέθηκε ρητή ονόματα πακέτων, υπέρ των εισαγωγών, για org.openscience.cdk στη μονάδα δεδομένων (διορθώσεις # 2783549)
- ξεμπλοκάρισμα της επιλογής αναδρομή στην AllRingsFinder
- Εξαγωγή από τη σειρά στοιχειώδη τύπο η χρέωση.
- Εξαγωγή από τη σειρά στοιχειώδη τύπο η χρέωση.
- Ελεγκτής της μάζας όταν είναι εκτός του εύρους
- Ενημέρωση για να προσθέσετε έξυπνα H σε ένα PLANAR3 Ν, διορθώνει bug 2781199
- Προστέθηκε τεστ για bug 2781199
- καλεί να CDKException κατασκευαστή γίνει μέσα σε ένα μπλοκ των αλιευμάτων περιλαμβάνουν πλέον τη ρίζα εξαίρεση τη διατήρηση στοίβα ίχνος
- καλεί να CDKException κατασκευαστή γίνει μέσα σε ένα μπλοκ των αλιευμάτων περιλαμβάνουν πλέον τη ρίζα εξαίρεση τη διατήρηση στοίβα ίχνος
- καλεί να CDKException κατασκευαστή γίνει μέσα σε ένα μπλοκ των αλιευμάτων περιλαμβάνουν πλέον τη ρίζα εξαίρεση τη διατήρηση στοίβα ίχνος
- καλεί να CDKException κατασκευαστή γίνει μέσα σε ένα μπλοκ των αλιευμάτων περιλαμβάνουν πλέον τη ρίζα εξαίρεση τη διατήρηση στοίβα ίχνος
- καλεί να CDKException κατασκευαστή γίνει μέσα σε ένα μπλοκ των αλιευμάτων περιλαμβάνουν πλέον τη ρίζα εξαίρεση τη διατήρηση στοίβα ίχνος
- καλεί να CDKException κατασκευαστή γίνει μέσα σε ένα μπλοκ των αλιευμάτων περιλαμβάνουν πλέον τη ρίζα εξαίρεση τη διατήρηση στοίβα ίχνος
- καλεί να CDKException κατασκευαστή γίνει μέσα σε ένα μπλοκ των αλιευμάτων περιλαμβάνουν πλέον τη ρίζα εξαίρεση τη διατήρηση στοίβα ίχνος
- καλεί να CDKException κατασκευαστή γίνει μέσα σε ένα μπλοκ των αλιευμάτων περιλαμβάνουν πλέον τη ρίζα εξαίρεση τη διατήρηση στοίβα ίχνος
- καλεί να CDKException κατασκευαστή γίνει μέσα σε ένα μπλοκ των αλιευμάτων περιλαμβάνουν πλέον τη ρίζα εξαίρεση τη διατήρηση στοίβα ίχνος
- καλεί να CDKException κατασκευαστή γίνει μέσα σε ένα μπλοκ αλιευμάτων περιλαμβάνει τώρα τη ρίζα εξαίρεση τη διατήρηση στοίβα ίχνος
- καλεί να CDKException κατασκευαστή γίνει μέσα σε ένα μπλοκ αλιευμάτων περιλαμβάνει τώρα τη ρίζα εξαίρεση τη διατήρηση στοίβα ίχνος
- καλεί να CDKException κατασκευαστή γίνει μέσα σε ένα μπλοκ αλιευμάτων περιλαμβάνει τώρα τη ρίζα εξαίρεση τη διατήρηση στοίβα ίχνος
- καλεί να CDKException κατασκευαστή γίνει μέσα σε ένα μπλοκ αλιευμάτων περιλαμβάνει τώρα τη ρίζα εξαίρεση τη διατήρηση στοίβα ίχνος
- καλεί να CDKException κατασκευαστή γίνει μέσα σε ένα μπλοκ αλιευμάτων περιλαμβάνει τώρα τη ρίζα εξαίρεση τη διατήρηση στοίβα ίχνος
- Προστέθηκε μια μονάδα ελέγχου για να εξασφαλιστεί πεδία SD έχουν διαβάσει για όλα τα μόρια
- χωρίσουν δοκιμή
- νέα αρχεία
- περισσότερες δοκιμές για ΧΜΛ ανάγνωση
- δοκίμιο Προστέθηκε για # 1848591: λανθασμένη πλαίσιο Murcko
- Σταθερή καστ, αφαιρέστε περιττές πλήρες όνομα του πακέτου
- Προστέθηκε δοκίμιο για # 2692107
- Διορθώθηκε τυπογραφικό λάθος: λείπει 's'
Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 1.2.1:
- Διορθώθηκε το bug 2714283, η οποία ρίχνει σωστά μια εξαίρεση, όταν δαχτυλίδια δεν έχουν κλείσει σωστά. Εάν ένας δακτύλιος δεν έχει κλείσει με τον κατάλληλο αριθμό δακτυλίου, InvalidSmilesException ρίχνεται. Αγώνες Daylight συμπεριφορά
- Διορθώθηκε το bug 2729120 και πρόσθεσε δοκιμή μονάδα
- Ενημέρωση σχόλιο για να διορθώσετε το σφάλμα 2.768.643.
- Μερική λύση για το σφάλμα 2719237. Made getBondOrderSum στατική, πρόσθεσε δοκιμή μονάδα για αυτό
- Typo: proteinl - & gt? πρωτεΐνη
- Made κύρους δημόσια, να unbreak προσθήκη του στο build / *. Javafiles
- Μερικώς σταθερή SMARTS ταιριάζουν για R0. Ενημερώθηκε προετοιμασίας μόριο-στόχο και να αναφέρεται ρητώς άτομα δεν είναι σε δαχτυλίδι, αλλά και ενημερωμένο άτομο RingMembership να κάνει ρητή επιταγή, όταν έχει καθοριστεί R0. Μερικώς διορθώνει bug 2587204
- Σταθερή αμφίβολη δοκιμασία της ισότητας. Μια ιδιωτική μέθοδος ελέγχου Δίκλινο αντικείμενα μέσω αναφοράς. Δούλεψε μια χαρά όταν ήταν μηδενική. Αποτυγχάνει όταν πρέπει να συγκρίνουμε με βάση την αξία. Κωδικός ενημερώνεται για να το λάβει υπόψη. Προστέθηκε μονάδα ελέγχου (και έκανε τη μέθοδο προστατεύονται έτσι ώστε να μπορεί να ελεγχθεί)
- Προστέθηκε μέθοδος δοκιμής σχολιασμό. Ολοκληρώνει την κάλυψη για τη μονάδα δεδομένων
- refactored ChiIndexUtils να καταστεί πακέτο ιδιωτικό. Καθαρίζει δημόσια API, δεδομένου ότι χρησιμοποιείται μόνο από chi κωδικό Περιγραφέας. Ενημερώθηκε όλα εξαρτώνται από τις κατηγορίες. Κωδικός μετακόμισε δοκιμής (η οποία πρέπει να συμπληρωθεί!), καθώς και
- Κωδικός εκκαθάριση των ChiIndexUtils. Μετατρέπονται σε 1,5 ιδιώματα
- Clean up του PathTools και πρόσθεσε μέθοδο δοκιμής σχολιασμό, έτσι ώστε πυρήνας καλύπτεται πλήρως
- Διορθώθηκε το προηγούμενο δεσμεύονται να επεξεργαστείτε τη γραμμή cdk.keyword, όχι η γραμμή cdk.module
- Περισσότερα συνεπείς λέξεις-κλειδιά που χρησιμοποιούνται
- Προστέθηκε μια δοκιμή για να εξασφαλίσει ότι οι Ακέραιος αντικείμενα σε σχέση με την αξία αντί αναφοράς
- Προστέθηκε μια δοκιμή για να ελέγξετε ότι diffs δοχείο άτομο είναι σωστές, όταν χρησιμοποιεί το αποσειριοποιημένου αντικείμενα
- Σταθερή IntegerDifference έτσι ώστε να ελέγχει πραγματικά την ακέραια τιμή παρά τις αναφορές του αντικειμένου Ακέραιος. Διορθώνει το πρόβλημα σύμφωνα με την οποία ένα αντικείμενο σε συνέχειες στο δίσκο και, στη συνέχεια, αποσειριοποιημένου δεν ταιριάζει με το αρχικό αντικείμενο (δηλαδή, μη κενή συμβολοσειρά ΜΔΠ)
- Εφαρμοσμένα μπάλωμα # 2675819 (Stefan Kuhn): Patch για να προσθέσετε ένα removeReaction να reactionSet
- Χρήση διασύνδεσης αντί της εφαρμογής
- Αφαιρέθηκε ένα αχρησιμοποίητο εισαγωγής
- Χρήση IAtomContainer αντί IMolecule, όπως η πραγματική αντιστοίχιση χρησιμοποιεί IAtomContainers ήδη (διορθώσεις # 2686249)
- Διορθώθηκε ένα ClassCastException (διορθώσεις # 2685134)
- Προστέθηκε πηγή attrib για να καθορίσει την οικοδόμηση του Ubuntu .deb
- Σταθερό σύστημα κατασκευής Βοήθεια: χρησιμοποιήστε βάζα doclet στο develjar /? ενημερώνεται για νέο φάκελο src src / κύρια? απομακρύνονται πολύ ξεπερασμένη χρήση rt.jar
- Αφαιρέθηκε libdepends περιλαμβάνουν για δοκιμή-ioformats, η οποία δεν έχει στην πραγματικότητα libdepends
- Ενημέρωση έτσι ώστε αν ένα άτομο-στόχο δεν έχει το σύμβολο (όπως άτομα ψευδο) ο αγώνας επιστρέφει false (όχι μια NPE)
- Διορθώθηκε το σωστό χειρισμό των #n εξυπνάδα querys
- Προστέθηκε τεστ για bug 2686473
- Προστέθηκε σημείωση σχετικά με Ant 1.7.1 απαιτείται
- Σταθερή πηγή NPE: «null == 2 'προκαλεί μια εξαίρεση, έτσι ώστε το πρώτο τεστ για nullness
- Σταθερή ειδοποίηση πνευματικών δικαιωμάτων για το 2009
- Σταθερή διπλούν αποθήκευση των προτύπων διάταξης, η οποία ανήκει μόνο στη μονάδα SDG, όχι επιπλέον μονάδα πάρα
- Συγχώνευση υποκατάστημα »local1.2» της ../../ git-svn / cdk
Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 1.2.0:
- Διορθώνει μερικά SMARTS parsing πρόβλημα, η χρήση των δύο -letter σύμβολα και IPseudoAtom στο Fingerprinter, και προσθέτει 4 νέους ορισμούς τύπου άτομο, για το ιώδιο και θείο.
Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 1.1.5:.
- Κυρίως διορθώσεις σφαλμάτων
Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 1.1.4:.
- Κυρίως μικρές διορθώσεις σφαλμάτων
Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 1.1.1:
- Κυρίως μικρές διορθώσεις σφαλμάτων και γενικός κωδικός καθαρίσει.
Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 1.1.0:.
- Πολλές, πολλές αλλαγές
Απαιτήσεις :
- Java 2 Standard Edition Runtime Environment
Τα σχόλια δεν βρέθηκε