Bio-Linux

Το Bio-Linux είναι ένα λειτουργικό σύστημα ανοικτού κώδικα που βασίζεται στην παγκόσμια & rsquo? S πιο δημοφιλή δωρεάν διανομή του Linux, Ubuntu, χτισμένο γύρω από το σύγχρονο περιβάλλον εργασίας Ενότητας, και έχει σχεδιαστεί από το μηδέν για να χρησιμοποιηθεί από bioinformaticians.Distributed ως ενιαία, διπλή-αψίδα Ζωντανή DVDThe διανομή μπορείτε να το κατεβάσετε από Softoware ως μια ενιαία, διπλή-αψίδα ζωντανές εικόνες DVD ISO περίπου 3GB σε μέγεθος, που υποστηρίζει τόσο 64-bit (x86_64) και 32-bit (i386) σύνολο εντολών αρχιτεκτονικές. Θα πρέπει να αναπτυχθεί είτε ένα USB flash drive ή DVD για να το εκκινήσετε από το BIOS του optionsBeing computer.Boot βασίζεται στο Ubuntu, διαθέτει την ίδια φορτωτή εκκίνησης, σχεδιασμένο για να σας επιτρέψει να δοκιμάσετε το λειτουργικό σύστημα χωρίς να εγκαταστήσετε τίποτα , ξεκινήστε άμεσα το πρόγραμμα εγκατάστασης, ελέγξτε τη μνήμη RAM για σφάλματα, εκκίνηση από το πρώτο δίσκο, καθώς και να ελέγξετε την ακεραιότητα του bootable μέσο (μόνο αν χρησιμοποιείτε ένα DVD μέσα ενημέρωσης) .Modern και παραγωγικό desktop περιβάλλον που τροφοδοτείται από UnityAs αναφέρθηκε, τη διανομή & rsquo ? s προεπιλογή και μόνο περιβάλλον εργασίας είναι Ενότητας, η οποία χρησιμοποιεί ένα πίνακα διάταξης / αποβάθρα. Ενώ η ειδική ομάδα, η οποία βρίσκεται στο επάνω μέρος της οθόνης, είναι ιδανικό για την αλληλεπίδραση με τα προγράμματα λειτουργίας, η δεξαμενή θα σας βοηθήσει να ξεκινήσει γρήγορα το αγαπημένο σας applications.Some από τα καλύτερα βιοπληροφορικής ανοικτού κώδικα appsSome από τις καλύτερες εφαρμογές βιοπληροφορικής ανοικτού κώδικα περιλαμβάνονται σε αυτό το Ubuntu-based λειτουργικό σύστημα, μεταξύ των οποίων μπορούμε να αναφέρουμε νόμου, της ARB Cn3D, Cytoscape, Αρχαιοπτέρυγα, Άρτεμις, BTmapqtl, ClustalX, Dendroscope, DDV Ακολουθία Ευθυγράμμιση Viewer, Entrez, Eqtl, Galaxy, GAP4, GAP5, FastQC, Geneious, GGobi, ISACreator, ο βασιλιάς, LRmapqtl, mesquite και Jemboss.Bottom lineSumming επάνω, Bio-Linux είναι ένα πολύ γρήγορο και παραγωγικό λειτουργικό σύστημα βασίζεται στην τελευταία έκδοση του Ubuntu ανάντη και χρησιμοποιώντας το γραφικό περιβάλλον GNOME Classic, καθώς και ορισμένα από τα καλύτερες εφαρμογές βιοπληροφορικής ανοικτού κώδικα

Τι είναι καινούργιο σε αυτή την έκδοση:.

• Διευθύνσεις ένα πρόσφατο τεύχος με την επιφάνεια εργασίας παραλείποντας να ξεκινήσετε στο VirtualBox λόγω μη συμβατά προγράμματα οδήγησης.
• Ενημερώσεις διάφορες συσκευασίες, κυρίως QIIME και Bowtie-Bio εργαλεία.
• Προσθέτει το pandaseq ζεύγη τέλος συναρμολόγησης.
• Προσθέτει τα ενημερωμένα Σεμινάριο αρχαρίων ειδικά για Bio-Linux 8.

Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 8.0.2:

• Νέα Ubuntu 14.04 βασικό σύστημα υποστηρίζει το πιο πρόσφατο υλικό και παρέχει up-to-ενημερωμένο λογισμικό γραφείου, πολυμέσα, κλπ.
• Ενημερωμένες εκδόσεις βασικές εφαρμογές βιοπληροφορικής, όπως QIIME, Mothur, Jalview, Άρτεμις, BLAST, Bowtie-Bio εργαλεία και πολλά άλλα (χρήστες που δεν αναβάθμιση θα πάρει πια ενημερώσεις).
• Up-to-ενημερωμένες εκδόσεις από πολλά πακέτα R, συμπεριλαμβανομένων ggplot2, DESeq και Edger συν ενημερώνεται Bioconductor και χιλιάδες περισσότερα πακέτα που είναι διαθέσιμα για άμεση εγκατάσταση μέσω C2D4U.
• Παροχή προπαρασκευασμένα πρότυπα για χρήση στο VMWare / VirtualBox.
• Αντικατάσταση του NX με x2go, μια πιο ευέλικτη έκδοση του γρήγορο και ασφαλές σύστημα απομακρυσμένης-desktop.
• Ένταξη της επιφάνειας εργασίας MATE ως ένα ελαφρύ εναλλακτική λύση για την Ενότητα.
• Μια πιο ισχυρή συσκευασία του Galaxy, με την υποστήριξη για τα εργαλεία εργαλείο-υπόστεγο φόρτωσης, Apache μεσολάβησης, αυτοματοποιημένη PostgreSQL set-up, έλεγχος ταυτότητας με τα τοπικά και upload αρχείων SFTP.
• Μια δωρεάν γατάκι με κάθε λήψη!
• ... εντάξει, μπορεί να έχω πει ψέματα για το γατάκι, αλλά έχουμε μερικά πανέμορφα νέες ταπετσαρίες που υποβλήθηκαν από την κοινότητα των χρηστών - βλέπε παρακάτω
.

Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 7.0.3:

• Bio-Linux 7 είναι ένα πλήρως εξοπλισμένο, ισχυρό , παραμετροποιήσιμο και εύκολο στη συντήρηση βιοπληροφορική εργασίας. Bio-Linux παρέχει περισσότερα από 500 προγράμματα βιοπληροφορικής σε Ubuntu Linux 12.04 LTS βάση. Υπάρχει ένα γραφικό μενού για τη βιοπληροφορική προγράμματα, καθώς και εύκολη πρόσβαση προς το Bio-Linux σύστημα βιοπληροφορικής τεκμηρίωσης και δείγμα στοιχεία χρήσιμα για προγράμματα δοκιμών.
• Bio-Linux 7 προσθέτει πολλές βελτιώσεις σε σχέση με τις προηγούμενες εκδόσεις, συμπεριλαμβανομένου του περιβάλλοντος ανάλυσης Galaxy. Υπάρχουν επίσης διάφορα πακέτα για να χειριστεί νέα γενιά τύπους δεδομένων ακολουθίας.
• Μπορείτε να εγκαταστήσετε το Bio-Linux στο μηχάνημά σας, είτε ως το μοναδικό λειτουργικό σύστημα, ή ως μέρος μιας εγκατάστασης διπλής εκκίνησης που σας επιτρέπει να χρησιμοποιείτε το τρέχον σύστημά σας και Bio-Linux στο ίδιο υλικό.
• Bio-Linux τρέχει επίσης ζωντανά από το DVD ή USB stick. Αυτό έρχεται στη μνήμη του υπολογιστή σας και δεν περιλαμβάνει την εγκατάσταση οτιδήποτε. Αυτό είναι ένα μεγάλο, μη ταλαιπωρία τρόπος για να δοκιμάσετε Bio-Linux, καταδεικνύουν ή να διδάξουν με αυτό, ή να συνεργαστεί με όταν είστε εν κινήσει.
• Bio-Linux είναι χτισμένο σε συστήματα λογισμικού ανοικτού κώδικα και, και έτσι είναι ελεύθερος να την εγκατάσταση και τη χρήση.