CLC Sequence Viewer

CLC Sequence Viewer δημιουργεί ένα περιβάλλον λογισμικού που επιτρέπει στους χρήστες να κάνουν ένα μεγάλο αριθμό της βιοπληροφορικής ανάλυσης, σε συνδυασμό με την ομαλή διαχείριση των δεδομένων, καθώς και εξαιρετικές επιλογές γραφική προβολή και την έξοδο.

Τι είναι καινούργιο σε αυτό το αφήστε:

Τα νέα χαρακτηριστικά και βελτιώσεις

• Όλες οι επικοινωνίες του server NCBI είναι τώρα κρυπτογραφημένα. (NCBI θα πρέπει να κινείται σε όλες τις υπηρεσίες web με το πρωτόκολλο HTTPS στις 30 Σεπτεμβρίου 2016) & nbsp?.

• Ο κατάλογος των ενζύμων προ-εγκατεστημένο στον πάγκο & nbsp? Έχει ενημερωθεί από αναπροσαρμόσετε.

• το εργαλείο Quick Launch τώρα βρίσκεται κάτω από το μενού Εργαλεία, αντί του μενού Προβολή και ένα κουμπί με το όνομα Launch που φέρνει αυτό το εργαλείο έχει προστεθεί στη γραμμή εργαλείων.

• Η επιλογή "δεν είναι στη λίστα» έχει εισαχθεί ως μια νέα επιλογή πίνακα φιλτραρίσματος.

• Η "Ταξινόμηση φάκελο" εργαλείο χρησιμοποιεί τώρα αριθμητική ταξινόμηση για ονόματα αρχείων πρόθεμα με έναν αριθμό.

• Νέα κράτησης θέσης είναι διαθέσιμες κατά τον καθορισμό των ονομάτων των εξόδων εξαγωγέα: & nbsp? {User}, & nbsp? {Υποδοχής}, και για τα στοιχεία του timestamp του αντικειμένου της παραγωγής, {έτους}, & nbsp? {Μήνας}, & nbsp? {Ημέρας}, & nbsp? {Ώρα, & nbsp? {Λεπτά}, & nbsp? . {δεύτερη} & nbsp?
• Τα σύμβολα κράτησης θέσης στο εσωτερικό ονόματα εξόδου εξαγωγής που ήταν προηγουμένως διαθέσιμες μόνο ως ψηφία μπορούν τώρα να καθοριστεί με τη χρήση γραπτών ονόματα: {είσοδο} είναι ένα συνώνυμο για {1}, {επέκταση} είναι συνώνυμο για {2} και {μετρητή} είναι ένα συνώνυμο για {3}.

• GenBank εισαγωγή τώρα επιτρέπει επίσης για ονόματα αρχείων με επέκταση "GBFF».

• Διαβάστε λεπτομέρειες ομάδα εμφανίζονται τώρα στην προβολή Στοιχείο Πληροφορίες λίστες ακολουθίας.

• Διορθώθηκε ένα σπάνιο ζήτημα όπου ορισμένοι σχολιασμοί θα μπορούσε , αλλά δεν απαραιτήτως, εξαφανίζονται σε & nbsp? ακολουθίες με μεγαλύτερη από 1000 σχολιασμούς ενός συγκεκριμένου τύπου σχετικά με αυτή τη σειρά πριν από τη διαγραφή και όπου χρησιμοποιήθηκε το πλαίσιο επιλογή μενού στο δεξί κλικ "Διαγραφή επιλογής" & nbsp?.

• Σταθερά ένα σφάλμα στον οδηγό "Διαχείριση ένζυμα" που απέτρεψε ένα χρήστη από την ακύρωση της δράσης, αν "Αποθήκευση ως νέο κατάλογο ένζυμο" ήταν ενεργοποιημένη.

• Διορθώθηκε το πρόβλημα με το εργαλείο Εισαγωγή μεταδεδομένων, όπου, αν είχε ήδη φορτωθεί ένα υπολογιστικό φύλλο, στη συνέχεια, επιλέγοντας το ίδιο υπολογιστικό φύλλο και πάλι δεν φορτώσετε εκ νέου το περιεχόμενο υπολογιστικό φύλλο.

• Σταθερά ένα θέμα όπου χρειάστηκε πολύς χρόνος για να ανοίξει ένα πάγκο που ήταν & nbsp? previouslyclosed όταν εμφανίζει μια ανοιχτή επεξεργαστή πινάκων που είχαν ταξινομηθεί & nbsp?.

• Σταθερά ένα θέμα όπου δεξί κλικ σε ένα γράφημα σε μια έκθεση και επιλέγοντας να δείξει "Ιστορία" "έκθεση", ή "Element Info" προκάλεσε ένα σφάλμα.

• Διάφορα ήσσονος σημασίας διορθώσεις .

Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 7.7:

• Όλα τα φύλλα του Excel σε ένα έγγραφο είναι τώρα εισάγονται και κάθε φύλλο έχει ένα τραπέζι που δημιουργήθηκε για το περιεχόμενό της.
• Το CSV, HTML και Excel εξαγωγέας πίνακα / πίνακα χρησιμοποιούν τώρα "Inf "και" NaN "τιμές για να αντικαταστήσει το διφορούμενη"; ".
• στον οδηγό για την εξαγωγή ενός πίνακα σε μορφή CSV, όταν δεν την εξαγωγή όλων των στηλών, είναι πλέον δυνατόν να ακυρώσει ή να πάτε πίσω στο προηγούμενο βήμα, ενώ οι επιλεγμένες στήλες φόρτωση & nbsp?.
• ίδιες ρυθμίσεις εκτύπωσης μπορεί τώρα να εφαρμοστεί για πολλαπλές αναφορές σε ένα ενιαίο εξαγωγή & nbsp?.
• Η "Διαχείριση Πόρων" καρτέλα έχει αφαιρεθεί από . η ο Διευθυντής Plugin

Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 7.6.1:

Διορθώσεις σφαλμάτων

• Διορθώθηκε το πρόβλημα όπου ορισμένες λειτουργίες φιλτραρίσματος, όπως "δεν περιέχει" δεν ενήργησε σωστά όταν το φιλτράρισμα πίνακα κύτταρα που περιείχαν πολλά κομμάτια των πληροφοριών.
• Σταθερή ένα ζήτημα όπου σχολιασμούς που κράτησε τα άκρα ενός κυκλικού ακολουθία θα πρέπει να τοποθετηθεί σωστά στην εγκύκλιο Sequence View.
• Διορθώθηκε ένα σφάλμα που προκάλεσε ο πάγκος εργασίας να παγώσει αν ορισμένες αλληλουχίες που εμφανίζονται στην κυκλική προβολή με ακτινική απόδοση ετικέτες.
• Διορθώθηκε το πρόβλημα όπου ορισμένες λειτουργίες φιλτραρίσματος, όπως "δεν περιέχει" δεν ενήργησε σωστά όταν το φιλτράρισμα πίνακα κύτταρα που περιείχαν πολλά κομμάτια των πληροφοριών.
• Διορθώθηκε το πρόβλημα ότι εμπόδισε ένα ριζικό φάκελο στα Windows οδηγεί από το να χρησιμοποιείται ως Τοποθεσία αρχείου.
• Σταθερά ένα θέμα όπου ενημερώνετε μια υπάρχουσα εγκατάσταση των Windows θα μπορούσε να οδηγήσει στο αρχείο .vmoptions διαγραφή, γεγονός που καθιστά την πορεία Πάγκος εργασίας με την . προεπιλεγμένη ρύθμιση Java

Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 7.6:

Τα νέα χαρακτηριστικά και βελτιώσεις

• Ένα 3D Molecule Viewer είναι τώρα διαθέσιμο για την απεικόνιση της πρωτεΐνης, RNA, DNA, και μικρά μόρια.
• Βελτιωμένη αναφορά σφαλμάτων που σχετίζονται με χαμηλό χώρο στο δίσκο.

• Διορθώθηκε το πρόβλημα με τις συνδέσεις και το κείμενο σε πίνακες που είχαν αποκοπεί όταν πετυχαίνοντας ένα σύνδεσμο
• ανάλυση θέσεων περιορισμού:. Οι τιμές "Κόψτε θέση (s) "στήλη του πίνακα ανάλυσης του χώρου περιορισμού συμπεριφέρεται τώρα σαν αριθμούς αντί για κείμενο, πράγμα που σημαίνει διαλογή και το φιλτράρισμα έργα.

• Ένα πρόβλημα με τις αποθηκευμένες ρυθμίσεις πίνακα που μερικές φορές δεν λειτούργησε έχει καθοριστεί. Η επιδιόρθωση σφαλμάτων περιλαμβάνει μια πιο ισχυρή / γενικό τρόπο εξοικονόμησης ρυθμίσεις τραπέζι με διαφορετικές στήλες. Για να διορθώσετε αυτό το πρόβλημα, οι υπάρχουσες αποθηκευμένες ρυθμίσεις πίνακα πρέπει πρώτα να φορτωθεί σε ένα αντικείμενο στο οποίο λειτουργεί (δηλαδή έχει τις ίδιες στήλες όπως όταν είχε σωθεί)? και τότε οι ρυθμίσεις του πίνακα θα πρέπει να αποθηκεύονται με το παλιό όνομα για να αντικαταστήσετε τις ρυθμίσεις & nbsp?

• Μεταδεδομένα για φυλογενετικά δέντρα: α. το σφάλμα έχει διορθωθεί & nbsp? με την εισαγωγή της στήλης μεταδεδομένων που περιέχουν ονόματα με άνω και κάτω τελεία.

• Διορθώθηκε το σφάλμα όταν δείχνει πρωτεΐνη μεταφράσεις των σχολιασμών μικρότερη από 3 βάσεις.

Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 7.5:.

• Οι αχρησιμοποίητες "Ροές" κουμπί έχει αφαιρεθεί από τη γραμμή εργαλείων
• τοπική αναζήτηση ενεργοποιηθεί από το μενού περιλαμβάνει τώρα το φιλτράρισμα στο "Μονοπάτι".
• για προχωρημένους φιλτραρίσματος στα τραπέζια περιλαμβάνει πλέον τη δυνατότητα να φιλτράρετε για ένα διάστημα, με κόμμα ή ερωτηματικό οριοθετημένη λίστες των όρων.
• εργαλεία Zoom επανασχεδιασμός:. Το ζουμ σε λειτουργία επιλογής είναι πλέον διαθέσιμη και για τις ακολουθίες, λίστες ακολουθίας, ευθυγραμμίσεις, και να διαβάσετε τις αντιστοιχίσεις
• Εξοικονόμηση / εφαρμογή των ρυθμίσεων πλευρά του πίνακα για πίνακες εργάζεται τώρα για διαφορετικούς πίνακες που μοιραστώ μερικές στήλες & nbsp?..

• λειτουργίες αντιγραφής μπορεί πλέον να σταματήσει

• εισαγωγή του Παραδείγματος δεδομένων και των εισαγωγών γίνεται μέσω σύροντας τα αρχεία στο πάγκο εργασίας και τη ρίψη τους στην περιοχή πλοήγησης δεν θα εμποδίζει πλέον τη διεπαφή χρήστη κατά την εκτέλεση. Αντ 'αυτού, η εισαγωγή συμβαίνει ως μια διαδικασία φόντο που μπορεί να παρακολουθείται και να ελέγχεται μέσω της καρτέλας Διεργασίες στην κάτω αριστερή γωνία.

• CLC πάγκοι τώρα υποστηρίζει οθόνες υψηλής ανάλυσης, όπως η Apple Retina οθόνες όλων των δεδομένων που εμφανίζονται στην περιοχή προβολής (συμπεριλαμβανομένων επεξηγήσεις).
• Περισσότερα ενημερωτικό ονομασία της κωδικοποίησης μεταφράσεις περιοχής που παράγεται από το εργαλείο Μετάφραση σε πρωτείνη. Το όνομα για μετάφραση κωδικοποίησης περιοχή αποτελείται από το όνομα της ακολουθίας εισόδου που ακολουθείται από το είδος σχολιασμού και, τέλος, το όνομα σχολιασμό.
  1 Oct 16 σε εκπαιδευτικές & επιστήμη λογισμικού, λογισμικού μαθηματικών