DOLFIN

Αυτό είναι ένα απλό, συνεπές και διαισθητικό αντικειμενοστραφή API σε C ++ και Python

Χαρακτηριστικά :.

• Αυτόματες και αποτελεσματική αξιολόγηση των πεπερασμένων στοιχείων μορφές Μεταβολική μέσω FFC ή SyFi
• Αυτόματη και αποδοτική συναρμολόγηση των γραμμικών συστημάτων
• Γενικές οικογένειες των πεπερασμένων στοιχείων, συμπεριλαμβανομένων των αυθαίρετη σειρά συνεχή και ασυνεχή Lagrange πεπερασμένα στοιχεία, στοιχεία BDM, RT στοιχεία, BDFM στοιχεία, Nedelec στοιχεία και Crouzeix-Raviart
• Αυθαίρετη μικτά στοιχεία ως συνδυασμός των βασικών στοιχείων, συμπεριλαμβανομένων, για παράδειγμα Taylor-Hood
• μεθόδους Galerkin Ασυνεχές συμπεριλαμβανομένων των όρων άλμα, μέσους όρους, και ολοκληρώματα σε έδρες εσωτερικό των ματιών
• Υψηλή απόδοση γραμμική άλγεβρα μέσω uBLAS, PETSc, Trilinos και MTL4 (σε πειραματικό στάδιο) με απλό C ++ και Python περιτυλίγματα
• Παράλληλη συναρμολόγηση και την επίλυση
• Simplex μάτια σε 1D, 2D (τρίγωνα) και 3D (τετράεδρα), συμπεριλαμβανομένων προσαρμοστικών προσαρμογή πλέγματος
• Multi-προσαρμοστική mcg (ιζ) / MDG (ιζ) και μονο-προσαρμοστική cG (ιζ) / ΓΔ (ιζ) λύτες ODE
• Υποστήριξη για μια σειρά από μορφές εισόδου / εξόδου, συμπεριλαμβανομένων DOLFIN XML, VTK, Octave, MATLAB, Diffpack, Έξοδος ΙΙ

Τι είναι καινούργιο σε αυτήν την έκδοση:

• Η έκδοση αυτή φέρνει ένα μεγάλο αριθμό καθαρισμούς και διορθώσεις σφαλμάτων σε σχέση με την πρόσφατα κυκλοφόρησε DOLFIN 1.0-β2.

Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 0.9.11:

• Αλλαγή άδεια από LGPL v2.1 να LGPL V3 ή αργότερα
• Μεταφέρθηκε meshconverter να dolfin_utils
• Προσθήκη υποστήριξης για τη μετατροπή των υλικών δεικτών όσον αφορά τα μάτια Gmsh
• Προσθήκη υποστήριξης για σημειακές πηγές (κατηγορία PointSource)
• Μετονομασία υλοτομία - & # x3e? set_log_active
• Προσθέστε την παράμετρο & quot? Clear_on_write & quot? σε χρονοσειρές
• Προσθήκη υποστήριξης για είσοδο / έξοδο των ένθετων σύνολα παραμέτρων
• Ελέγξτε για τις διαστάσεις στις γραμμικές λύτες
• Προσθήκη υποστήριξης για αυτόματο έλεγχο σφαλμάτων για Μεταβολική προβλήματα
• Προσθήκη υποστήριξης για βελτίωση των MeshFunctions μετά τον εξευγενισμό των ματιών
• Αλλαγή της σειράς των δοκιμών και τη δίκη χώρων σε κατασκευαστές Φόρμα

Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 0.9.10:

• Προσθήκη υποστήριξης για αυτόματο έλεγχο σφαλμάτων για Μεταβολική προβλήματα.
• Προσθήκη υποστήριξης για βελτίωση των MeshFunctions μετά τον εξευγενισμό των ματιών.

Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 0.9.9:

• Αλλαγή μεταγλώττιση του συστήματος να CMake
• Προσθέστε το όνομα MeshFunctions: VertexFunction, EdgeFunction, FaceFunction, FacetFunction, CellFunction
• Αφήστε τον καθορισμό σταθερή συνοριακές συνθήκες απ 'ευθείας χωρίς την χρήση Σταθερή
• Αφήστε τον καθορισμό οριακών συνθηκών με βάση κορδόνι (& quot? X [0] == 0,0 & quot?)
• Δημιουργία λείπουν καταλόγους αν καθορίζεται ως τμήμα των ονομάτων αρχείων
• Να επιτρέπεται η επαναχρησιμοποίηση των preconditioners για περισσότερες backends
• Διορθώσεις για UMFPACK λύτης για περίπου 32 μηχανές bit
• Παροχή πρόσβασης σε περισσότερα Hypre preconditioners μέσω PETSc
• Ενημερώσεις για SLEPc 3.1
• Βελτίωση και εφαρμογή της επαναχρησιμοποίησης του LU παραγοντοποιήσεων για όλες τις backends
• Διόρθωση bug στην τελειοποίηση των MeshFunctions

Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 0.9.3:

• Προσθήκη παγκόσμια παράμετρο & quot? Ffc_representation & quot? για την εκπροσώπηση μορφή στην FFC ΚΟΕ compiler
• Κάντε κανόνας λειτουργία () να χειρίζονται και τα δύο οχήματα και τις λειτουργίες σε Python
• Επιτάχυνση συνθήκες περιοδικές όριο και να κάνει την εργασία για τις μικτές (διάνυσμα-αξία) στοιχεία
• Προσθέστε δυνατότητες να χρησιμοποιήσετε οποιαδήποτε συστοιχία αριθμός NumPy κατά την ανάθεση μήτρες και φορείς
• Προσθέστε δυνατότητες να χρησιμοποιήσετε οποιοδήποτε ακέραιο NumPy σειρά για τους δείκτες σε πίνακες και διανύσματα
• Διόρθωση για typemaps int σε PyDOLFIN
• Σπλιτ mult σε πολλ και transpmult
• Φιλτράρισμα επιχείρημα PETSc όταν parsing παραμέτρους γραμμής εντολών
• Επέκταση σχόλια Γουλιά αρχεία διεπαφή
• Προσθήκη δηλώσεις πνευματικών δικαιωμάτων σε αρχεία διεπαφής SWIG (δεν έχει ολοκληρωθεί ακόμη)
• Προσθήκη typemaps για Διάφορα std :: διάνυσμα & # X3C? Τύπους & # x3e? σε PyDOLFIN
• Κατάργηση των εξαρτήσεων από std_vector.i μείωση του μεγέθους SWIG κωδικό περιτύλιγμα
• Χρησιμοποιήστε σχετική% περιλαμβάνει dolfin.i
• αλλάξει τα ονόματα στα αρχεία διεπαφής SWIG dolfin_foo.i - & # x3e? foo.i
• Προσθήκη παρεμβάλει λειτουργία () στην Python διεπαφή
• typmaps Fix για uint στην Python 2.6
• Χρήση TypeError αντί ValueError σε typechecks σε typmaps.i
• Προσθήκη in / out shared_ptr & # X3C? Epetra_FEFoo & # x3e? typemaps για PyDOLFIN
• Fix ΚΟΕ μεταγλώττισης παράλληλα
• Προσθήκη λειτουργία compile_extension_module σε PyDOLFIN
• Διόρθωση bug στην Python εκχώρηση φορέα
• Προσθήκη υποστήριξης για συμπιεσμένα base64 κωδικοποιημένα αρχεία VTK (χρησιμοποιόντας το zlib)
• Προσθήκη υποστήριξης για base64 κωδικοποιημένα αρχεία VTK
• Πειραματική υποστήριξη για παράλληλη συναρμολόγηση και την επίλυση
• Bug fix στο έργο () λειτουργία, την ενημέρωση για τη σύνταξη UFL
• Κατάργηση disp () λειτουργίες και να αντικατασταθεί από πληροφορίες (foo, αλήθεια)
• Προσθήκη δοκιμή FEM μονάδα (Python)
• Καθαρίστε SystemAssembler
• Ενεργοποίηση assemble_system μέσω PyDOLFIN
• Προσθήκη «κανόνας» για GenericMatrix
• Οι βελτιώσεις στην αποδοτικότητα NewtonSolver
• Μετονομασία NewtonSolver :: get_iteration () για να NewtonSolver :: επανάληψη ()
• Βελτιώσεις στα EpetraKrylovSolver :: λύσει
• Προσθήκη κατασκευαστή Vector :: διάνυσμα (const GenericVector & x)
• Κατάργηση SCons προειδοποιήσεις αποδοκιμασία
• Διαρροή μνήμης αποτύπωση σε PETScKrylovSolver
• Μετονομασία dolfin_assert - & # x3e? διεκδικήσει και χρησιμοποιήστε το C ++ έκδοση
• Διόρθωση σφαλμάτων / βελτιστοποίηση σημαίες
• Κατάργηση AvgMeshSize, InvMeshSize, InvFacetArea από SpecialFunctions
• Μετονομασία MeshSize - & # x3e? CellSize
• σύστημα παραμέτρων Επανεγγραφή με βελτιωμένη υποστήριξη για γραμμής εντολών ανάλυσης,
• εντοπισμός των παραμέτρων (ανά κατηγορία) και της χρηστικότητας από Python
• Κατάργηση OutflowFacet από SpecialFunctions
• Μετονομασία παρεμβάλει (διπλή *) - & # x3e? interpolate_vertex_values ​​(διπλή *)
• Προσθήκη Python έκδοση του Cahn-Hilliard demo
• Διόρθωση bug στο assemble.py
• Άδεια παρεμβολή των λειτουργιών μεταξύ των ματιών δεν ταιριάζουν
• Κατάργηση Λειτουργία :: Λειτουργία (std :: κορδόνι αρχείου)
• Η μετάβαση στο νέο XML IO
• Κατάργηση GenericSparsityPattern :: είδος
• Απαίτηση ταξινομημένο / ασυσκεύαστα παράμετρος σε SparsityPattern κατασκευαστή
• Βελτίωση της απόδοσης της SparsityPattern :: ένθετο
• Αντικαταστήστε enums με χορδές για τη γραμμική άλγεβρα και ενσωματωμένο ματιών
• Να επιτρέπεται η άμεση πρόσβαση σε σταθερή τιμή
• Αρχικοποίηση οντότητες MeshEntity κατασκευαστής αυτόματα και ελέγξτε εύρος
• Προσθήκη δοκιμές μονάδα στην memorycheck
• Νέα κλήση για να καθαρίσει libxml2 αναλυτή στην έξοδο
• Κατάργηση περιττά επιχειρήματα συναρτήσεις-μέλη DofMap
• Κατάργηση κατασκευαστές αναφοράς από DofMap, FiniteElement και FunctionSpace
• Χρησιμοποιήστε ένα shared_ptr να αποθηκεύσετε το μέγεθος των ματιών DofMap αντικείμενα
• αλλαγή διασύνδεσης για κωδικό περιτύλιγμα: PoissonBilinearForm - & # x3e? Poisson :: BilinearForm
• Προσθήκη info_underline λειτουργίας () για το γράψιμο υπογράμμισε μηνύματα
• Μετονομασία μηνύματος () - & # x3e? Πληροφορίες () για & quot? συμβατότητα & quot? με μονάδα Python υλοτομία
• Προσθήκη elementwise πολλαπλασιασμό GeneriVector διεπαφή
• διασύνδεση GenericVector σε PyDOLFIN υποστηρίζουν τώρα το πρωτόκολλο ακολουθία
• Μετονομασία του camelCaps λειτουργίες ονόματα: FOOBAR - & # x3e? foo_bar
• Προσθήκη τεμαχισμό δυνατότητες για GenericMatrix διεπαφή PyDOLFIN (μόνο GetItem)
• Προσθήκη τεμαχισμό δυνατότητες για GenericVector διεπαφή PyDOLFIN
• Προσθήκη στο ποσό GenericVector διεπαφή