XDrawChem

XDrawChem είναι ένα δισδιάστατο μόριο πρόγραμμα σχεδίασης για τα λειτουργικά συστήματα Unix. XDrawChem είναι παρόμοια σε λειτουργία με άλλα προγράμματα μόριο κατάρτιση, όπως ChemDraw (TM, CambridgeSoft).
Μπορεί να διαβάσει και να γράψει MDL Molfiles, και να διαβάσετε ChemDraw κειμένου και δυαδικά αρχεία, για να καταστεί δυνατή η ανταλλαγή μεταξύ XDrawChem και άλλες εφαρμογές της χημείας, και μπορεί να δημιουργήσει εικόνες σε δημοφιλείς μορφές, όπως PNG και EPS. XDrawChem έχει δοκιμαστεί σε Linux, SGI IRIX 6.5, Sun Solaris, Mac OS X και Windows.
Εδώ είναι μερικά βασικά χαρακτηριστικά του "XDrawChem":
· 100% συμβατό με τα Windows 95/98 / NT έκδοση
· Σταθερό μήκος, σταθερή γωνία σχεδίασης.
· Αυτόματη ευθυγράμμιση του στοιχεία. Ανιχνεύει τις δομές, το κείμενο, και βέλη και τα τοποθετεί αυτόματα.
· Μπορεί να τραβάει τα δαχτυλίδια και άλλες δομές - διαθέτει όλες τις βασικές αμινοξέων και νουκλεϊκών οξέων σε ενσωματωμένη βιβλιοθήκη.
· Μπορεί να ανακτά τις δομές από μια βάση δεδομένων του δικτύου με βάση τον αριθμό CAS, τον τύπο ή το όνομα.
· Μπορεί να επιστήσω σύμβολα όπως μερική φόρτιση, ρίζες, κ.λπ.
· Μπορεί να διαβάσει MDL Molfiles, CML [Χημικών Markup Language, που ορίζονται στο J. Chem. INF. Comput. Sci.39 (1999), 928-942], ChemDraw (TM) δυαδική μορφή, ChemDraw (TM) μορφή κειμένου XML.
· Μπορεί να γράψει MDL Molfiles, CML, ChemDraw (TM) μορφή κειμένου XML.
· Μπορεί επίσης να διαβάσει και να γράψει οποιαδήποτε μορφή που υποστηρίζεται από την τρέχουσα έκδοση του OpenBabel.
· Μπορεί να εξάγει εικόνες σε μορφή PNG, τα Windows bitmap (* .bmp), Encapsulated PostScript (EPS), και το Scalable Vector Graphics (SVG).
· Μπορεί να δημιουργήσει 3-D δομές με τη βοήθεια του εξωτερικού BUILD3D πρόγραμμα.
· Ηλεκτρονική βοήθεια, συμπεριλαμβανομένων συμβουλές εργαλείων.
· Πρόβλεψη 13C-NMR, με βάση Bremser W, Mag. Res. Chem.23 (4): 271-275
· Πρόβλεψη 1Η-NMR, με βάση τους κανόνες προσθέτου και λειτουργικών μεθόδων συμβούλευσης ομάδα, που περιγράφεται στο Pretsch, Clerc, Seibl, Simon, "Πίνακες φασματικά δεδομένα για την Δομή Προσδιορισμός Organic Compounds", 2ed., 1989, Springer-Verlag
· Απλή πρόβλεψη IR.
· Απλή εκτίμηση pKa.
· Εκτίμηση του συντελεστή κατανομής οκτανόλης-νερού.
· Ανάλυση Αντίδραση: αέριας φάσης εκτίμηση αλλαγή ενθαλπίας, 1Η NMR και σύγκριση 13C NMR.
· Ενσωμάτωση με OpenBabel, επιτρέποντας XDrawChem να διαβάσει και να γράψει πάνω από 20 διαφορετικές μορφές χημικών αρχείων.
Απαιτήσεις:
· UNIX και τα X Windows (Linux, SGI IRIX, Sun Solaris, άλλοι ...) ή το Mac OS X
· ANSI C ++ compiler (εγώ χρησιμοποιώ g ++)
· Qt 3.0 ή νεότερη έκδοση
· OpenBabel 1.100.2 ή αργότερα
Τι νέο υπάρχει σε αυτήν την έκδοση:
· Ο κώδικας έχει ενημερωθεί ώστε να λειτουργεί με OpenBabel 2.0.
· Λίγα ήσσονος σημασίας σφάλματα στη μεταφορά αρχείων και ετικέτες κειμένου έχουν καθοριστεί.
· Αυτή η έκδοση μπορεί να εξάγει απευθείας στα προγράμματα 3D modeling.