MACS2 είναι ένα μοντέλο που βασίζεται εργαλείο ανάλυσης για τσιπ Seq δεδομένων.
Με τη βελτίωση των τεχνικών αλληλουχίας, ανοσοκατακρήμνισης χρωματίνης που ακολουθείται από υψηλό αλληλουχίας απόδοση (τσιπ Seq) γίνεται όλο και δημοφιλής για τη μελέτη του γονιδιώματος σε επίπεδο αλληλεπιδράσεις πρωτεΐνης-DNA. Για να αντιμετωπιστεί η έλλειψη ισχυρή μέθοδο ανάλυσης τσιπ Seq, παρουσιάζουμε ένα νέο αλγόριθμο, που ονομάζεται μοντέλο με βάση την ανάλυση των τσιπ Seq (MAC), για τον προσδιορισμό του παράγοντα μεταγραφής θέσεις πρόσδεσης. MACS συλλαμβάνει την επιρροή της πολυπλοκότητας του γονιδιώματος για να αξιολογήσουν τη σημαντικότητα των εμπλουτισμένων περιοχές ChIP, και Mac βελτιώνει την χωρική ανάλυση των θέσεων πρόσδεσης συνδυάζοντας τις πληροφορίες τόσο τις θέσεις των ετικετών αλληλουχίας και προσανατολισμό. . Υπολογιστές Mac μπορούν να χρησιμοποιηθούν εύκολα για τσιπ Seq δεδομένων και μόνο, ή με το δείγμα ελέγχου με την αύξηση της ειδικότητας
Απαιτήσεις :
- Python
Τα σχόλια δεν βρέθηκε