MacVector

        Το MacVector είναι μια ολοκληρωμένη εφαρμογή Macintosh που παρέχει επεξεργασία ακολουθιών, σχεδιασμό αστάρι, αναζήτηση βάσης δεδομένων στο Internet, ανάλυση πρωτεϊνών, επιβεβαίωση αλληλουχίας, ευθυγράμμιση πολλών ακολουθιών, φυλογενετική ανασυγκρότηση, ανάλυση κωδικοποίησης περιοχής και μεγάλη ποικιλία άλλων λειτουργιών. Το MacVector θεωρείται ευρέως ως το πιο διαισθητικό, εύχρηστο πρόγραμμα που διατίθεται για ανάλυση αλληλουχίας.
    

Τι είναι καινούργιο σε αυτή την έκδοση:

Ορισμένα δευτερεύοντα ζητήματα με Ευθυγράμμιση στην αναφορά όταν διαβάζεται ευθυγραμμισμένο ξεκινώντας από το τελευταίο υπόλειμμα κυκλικών ακολουθιών έχει καθοριστεί.

Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 16.0.6:

Ορισμένα δευτερεύοντα ζητήματα με Ευθυγράμμιση με αναφορά όταν διαβάζεται ευθυγραμμισμένο ξεκινώντας από το τελευταίο υπόλειμμα κυκλικών ακολουθιών έχει καθοριστεί.

Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 16.0.2:

Έχει αποκατασταθεί μια συντριβή κατά την κλήση της λειτουργίας Align to Add Add Seqs στο OS X 10.7 και στο OS X 10.8 .

Όταν εξαγάγετε μια ακολουθία σε μορφή GenBank, ο MacVector γράφει τώρα όλες τις δυνατότητες του GenBank, ακόμη και αν αυτές είναι σήμερα απαρχαιωμένες.

Τι νέο υπάρχει στην έκδοση 15.5.4:

Η έξοδος διπλού digest Enzyme Restriction λειτουργεί τώρα όπως αναμένεται όταν επιλέγονται μόνο δύο ή τρία ένζυμα.

Τι νέο υπάρχει στην έκδοση 15.1.4:

Η μετάφραση πλαισίου 3/6 στον επεξεργαστή μονής ακολουθίας διατηρεί σωστά το πλαίσιο
μετά από μια περιτύλιξη γραμμής.

Μια συντριβή κατά την ενεργοποίηση της μετάφρασης πλαισίου 3/6 στον Αναλυτή Αναφοράς Αναφοράς με ένα
Η αλληλουχία μεγαλύτερη από 65.000 υπολειμμάτων έχει διορθωθεί.

Τι νέο υπάρχει στην έκδοση 15.1.3:

Έχει διορθωθεί σφάλμα στον επεξεργαστή ευθυγράμμισης αλληλουχίας πολλαπλών ακολουθιών . Το αποτέλεσμα αυτού του σφάλματος ήταν ότι πρόσθετα κατάλοιπα εμφανίστηκαν μερικές φορές στην αρχή των ακολουθιών όταν σώθηκαν. Αυτό επηρέασε μόνο τα έγγραφα MSA που έχουν επεξεργαστεί. Αν ευθυγραμμίσατε ακριβώς με το ClustalW / Muscle / T-Coffee και αποθηκεύσατε χωρίς επεξεργασία, οι ευθυγραμμίσεις θα ήταν σωστές.

Τι νέο υπάρχει στην έκδοση 15.1.1:

Σφάλματα κατά την αποθήκευση συγκεκριμένης ευθυγράμμισης πολλών ακολουθιών
(.msan, .msap) έχουν επιλυθεί.

Ένα σφάλμα, στο οποίο διαβάζονται ορισμένες γρήγορες αναγνώσεις, θα έχει καταγραφεί πολλές φορές από τα αποτελέσματα μιας αναζήτησης στο φάκελο Align To Folder (Αιτιολόγηση στο φάκελο Align To Folder) έχει επιδιορθωθεί.

Τι είναι καινούργιο στην έκδοση 14.5.3: p>

Έχει επισκευαστεί μια περιστασιακή συντριβή στη λειτουργία Align To Folder.

Μια σπάνια συντριβή κατά τη δοκιμή ζευγών εκκινητών έχει καθοριστεί

Τι νέο υπάρχει στην έκδοση 14.5.2:

Ο κατάλογος Align To Folder τώρα χειρίζεται αναζητήσεις χρησιμοποιώντας ένα τμήμα μιας αλληλουχίας που διασχίζει την κυκλική προέλευση.

Η ενεργοποίηση / απενεργοποίηση της "Αυτόματης αναζήτησης RE" στις προτιμήσεις χαρτών ενημερώνει σωστά όλα τα ανοιχτά παράθυρα.

Τι νέο υπάρχει στην έκδοση 14.0:

Μαζί με την ενίσχυση της απόδοσης όταν εργάζεστε με μεγάλες ακολουθίες και ευθυγραμμίσεις, υπάρχουν σημαντικές βελτιώσεις στο χειρισμό των αρχικών τεμαχίων (συμπεριλαμβανομένης της υποστήριξης για τις βάσεις δεδομένων εκκινητών) και των δεδομένων NGS.

Τι νέο υπάρχει στην έκδοση 13.5.5:

Ένα πρόβλημα όπου χαρακτηριστικά του τύπου "????" θα δημιουργηθεί κατά το άνοιγμα ενός αποθηκευμένου αρχείου Align To Reference (.axml) έχει επιλυθεί.

Τι νέο υπάρχει στην έκδοση 13.5.3:

• Η οθόνη Contig Editor ανανεώνεται τώρα σωστά στο OS X 10.6 κατά την φόρτωση μιας αποθηκευμένης ευθυγράμμισης.
• Μια συντριβή έχει διορθωθεί στο Toolbox Analysis Toolbox.
• Η συντριβή στη διεπαφή Quicktest Primer όταν εργάζεστε με μεγάλο αριθμό ενζύμων περιορισμού έχει καθοριστεί.

Τι νέο υπάρχει στην έκδοση 13.5.2:

Έχει επιλυθεί ένα θέμα κύλισης στο Editor Contig / Align To Reference Editor. Μια σπάνια σύγκρουση όταν ξυπνάτε σε ένα διαφορετικό δίκτυο έχει καθοριστεί.

Τι νέο υπάρχει στην έκδοση 13.5.1:

• Στο OS X 10.6, οι εισαγόμενες ακολουθίες διατηρούν τώρα το αρχικό τους όνομα αρχείου.
• Έχει επισκευαστεί περιστασιακά τροποποιημένες ακολουθίες που δεν έχουν αποθηκευτεί.
• Οι μεταφράσεις στην έξοδο σχολιασμένου κειμένου ταιριάζουν σωστά τις σημαίες προτιμήσεων.
• Λήφθηκαν κάποιες ασυνέπειες στην αρίθμηση των ακολουθιών "untitled".
• Έχει επιλυθεί ένα πρόβλημα όπου τα παράθυρα αλληλουχίας θα εξαφανιστούν κάτω από το OS X 10.6,
• Έχουν διορθωθεί αρκετές δυσλειτουργίες στην οθόνη του επεξεργαστή Αναφοράς σε Αναφορά.
• Ένα πρόβλημα με το οποίο μερικές φορές λείπουν οι μεταφράσεις στην καρτέλα Χάρτης όταν έχει μεγεθυνθεί στο επίπεδο των υπολειμμάτων έχει καθοριστεί.
• Η δυνατότητα εισαγωγής αρχείων BAM σε ένα έργο Assembler έχει αποκατασταθεί.
• Τα έγγραφα πολλαπλής ευθυγράμμισης των νουκλεϊνικών οξέων έχουν τώρα τη δική τους ομάδα χρωμάτων και την αποκλεισμό των προεπιλογών.
• Οι εκκινητές στον τρόπο λειτουργίας Primer Design "Test PCR Primer Pair" μπορούν πλέον να είναι πάνω από 35 nt.
• Οι προβολές κειμένου τώρα αλλάζουν αυτόματα το πλάτος για εκτύπωση σε μία σελίδα.

Τι νέο υπάρχει στην έκδοση 13.5:

Ο επεξεργαστής συμβόλων γραφικών και η πλωτή γραφική παλέτα έχουν ξαναγραφτεί κατά την προετοιμασία για την μετακίνηση του MacVector σε αρχιτεκτονική 64 bit (λόγω του MacVector 14.0). Οι άλλες βασικές βελτιώσεις έχουν ως στόχο τον καλύτερο χειρισμό των αρχείων ακολουθίας επόμενης γενιάς (NGS), ιδιαίτερα με τη λειτουργικότητα συναρμολόγησης Align To Folder και Assembler Velvet de novo. Υπήρξε επίσης κάποια βελτιστοποίηση κώδικα για την καλύτερη διαχείριση της ανάλυσης μεγάλων γονιδιωματικών αλληλουχιών, ιδιαίτερα αξιοσημείωτη με τη λειτουργικότητα "dot-plot" του Matrix Puster.