Σφραγίδα είναι μια ενότητα Python που παρέχει ευθυγράμμιση ακολουθίας στο Hadoop.Seal είναι ένα από MapReduce αίτηση για τη βιολογική ευθυγράμμιση ακολουθίας. Τρέχει σε Hadoop (http://hadoop.apache.org) μέσω Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), ένας...
TRMiner είναι ένα βοηθητικό πρόγραμμα Python που στοχεύει στην επιστημονικά δεδομένα επιμελητές & nbsp?. Επιτρέπει να κλαδέψετε γρήγορα μεγάλες συλλογές των επιστημονικών δημοσιεύσεων σε ποινές που αφορούν ένα συγκεκριμένο στόχο εξόρυξης.Αυτό...
Pysam είναι μια μονάδα Python για την ανάγνωση και το χειρισμό Samfiles & nbsp?. Είναι ένα ελαφρύ περιτύλιγμα του samtools C-API.Ο οδηγός γρήγορης εκκίνησης είναι εδώ. Πιο λεπτομερή τεκμηρίωση είναι διαθέσιμη εδώ.Ερωτήσεις και σχόλια είναι ευπρόσδεκτα και...
PySCeS είναι ένα έργο που αναπτύχθηκε από την Triple-J Ομάδα για Molecular Cell Physiology & nbsp?., Προκειμένου να προσπαθήσουμε μοντέλο και να κατανοήσουν τις περίπλοκες διαδικασίες και τα συστήματα που συνθέτουν το ζωντανό κύτταρο Χαρακτηριστικά :. ...
γοβιούς είναι ένα Python API για την ανάγνωση δυαδικά αρχεία δεδομένων που δημιουργούνται με τη χρήση του Goby next-gen πλαίσιο διαχείρισης δεδομένων.Κανονικά, αυτός ο κατάλογος έρχεται ως μέρος του πλήρους πακέτου Goby, διαθέσιμο από:& Nbsp? Http:...
SSuMMo είναι μια βιβλιοθήκη λειτουργιών για περίπου επαναληπτικό χρησιμοποιώντας hmmer να εκχωρήσετε ακολουθίες σε taxa & nbsp?. Τα αποτελέσματα είναι εξαιρετικά σχολιασμένη δέντρα δείχνουν ότι το γένος / κατανομής του γένους εντός της...
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) αποτελεί ένα αποτελεσματικό πρόγραμμα που ευθυγραμμίζει σχετικώς βραχείες αλληλουχίες νουκλεοτιδίου ενάντια σε μια μακρά ακολουθία αναφοράς, όπως το ανθρώπινο γονιδίωμα.Το λογισμικό που υλοποιεί δύο αλγόριθμους, BWA-σύντομη...
Η τύρφη είναι μια σουίτα προγραμμάτων για την καταγραφή, την πρόβλεψη και ανάλυση των βιοφυσικών χαρακτηριστικών των πρωτεϊνών.Δείτε http://enzyme.ucd.ie/PEAT για την τεκμηρίωση, οδηγίες, εικόνες κ.λπ. Απαιτήσεις :. ...
OpenElectrophy είναι ένα πλαίσιο που θα διευκολύνει το χειρισμό, την αποθήκευση και ανάλυση των δεδομένων ηλεκτροφυσιολογικές. Μπορεί να εισάγει δεδομένα από πολλές διαφορετικές μορφές αρχείων και να τα αποθηκεύσετε σε μια ενιαία βάση δεδομένων...
NEO (Νευρωνικά Ensemble αντικείμενα) και είναι ένα έργο που παρέχει ένα κοινό σύνολο βασικών κλάσεων που θα χρησιμοποιηθούν σε νευρικά ανάλυση των δεδομένων, με σκοπό να πάρει OpenElectrophy, NeuroTools και ίσως και άλλα έργα με παρόμοιους στόχους πιο...
