Genepidgin είναι μια σουίτα του Python εργαλεία που βοηθούν σε ονόματα προϊόντων και αξιολόγησης του γονιδίου εκχώρηση & nbsp? Υπάρχουν τρία βασικά συστατικά.:genepidgin * καθαριστικό *& Nbsp? Τυποποιεί ονόματα γονιδίων ανά UniProt οδηγίες...
ΒΗΜΑΤΑ είναι ένα πακέτο για την ακριβή στοχαστική προσομοίωση των συστημάτων αντίδρασης-διάχυσης οσοδήποτε σύνθετες 3D γεωμετρίες. Αλγόριθμο πυρήνα προσομοίωσης μας είναι μια υλοποίηση του SSA Gillespie, η επεκταθεί ώστε να ασχοληθεί με την διάχυση των...
TRMiner είναι ένα βοηθητικό πρόγραμμα Python που στοχεύει στην επιστημονικά δεδομένα επιμελητές & nbsp?. Επιτρέπει να κλαδέψετε γρήγορα μεγάλες συλλογές των επιστημονικών δημοσιεύσεων σε ποινές που αφορούν ένα συγκεκριμένο στόχο εξόρυξης.Αυτό...
Το σύστημα συγκριτικής αξιολόγησης Βιοπληροφορική είναι μια προσπάθεια να οικοδομήσουμε ένα λογικό πλαίσιο δοκιμών, δοκιμές, και τα δεδομένα, ώστε οι τελικοί χρήστες και οι προμηθευτές να εξετάσουν την απόδοση των συστημάτων τους.Αυτό που προσπαθούμε να...
Πακέτο Staden είναι ένα πλήρως ανεπτυγμένο σύνολο του συνέρχεσθαι αλληλουχία DNA (Gap4), επεξεργασία και εργαλεία ανάλυσης (Spin) για Unix, Linux, MacOSX και MS Windows.Στο μπροστινό Gap4 υπήρξαν αρκετές ήσσονος σημασίας που ενώνει συναφώνβελτιώσεις στο...
Arem είναι μια βάση για τα MAC (μοντέλο ανάλυσης Βασισμένο για τσιπ Seq δεδομένων).Αλληλουχίας υψηλής απόδοσης συζευγμένη με χρωματίνη άνοσο- κατακρήμνισης (τσιπ Seq) χρησιμοποιείται ευρέως για τον χαρακτηρισμό του γονιδιώματος σε επίπεδο πρόσδεσης μοτίβα...
seriesoftubes είναι μια εκτεταμένη αγωγού για Solexa τσιπ επόμενα δεδομένα.Πακέτο Τεκμηρίωσης Απαιτήσεις : ...
MetagenomeDB είναι μια βιβλιοθήκη Python σχεδιαστεί για εύκολη αποθήκευση, ανάκτηση και να σχολιάσετε μεταγονιδιωματική ακολουθίες & nbsp?. MetagenomeDB πράξη ως στρώμα αφαίρεσης πάνω από μια βάση δεδομένων MongoDB. Αυτό παρέχει ένα API για να...
Σφραγίδα είναι μια ενότητα Python που παρέχει ευθυγράμμιση ακολουθίας στο Hadoop.Seal είναι ένα από MapReduce αίτηση για τη βιολογική ευθυγράμμιση ακολουθίας. Τρέχει σε Hadoop (http://hadoop.apache.org) μέσω Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), ένας...
MISO (μίγμα ισομορφών) είναι ένα πιθανοτικό πλαίσιο γραμμένο σε Python που ποσοτικοποιεί το επίπεδο έκφρασης & nbsp? Από εναλλακτικό μάτισμα γονιδίων από RNA-Seq δεδομένων, και εντοπίζει διαφορικά ρυθμιζόμενες ισομορφές ή εξώνια όλη δείγματα.Με τη...
